Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm21972J3QN38 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm21972J3QN38 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm21972J3QN38 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm21972J3QN38 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm21972J3QN38 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm21972J3QN38 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm21972J3QN38 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm21972J3QN38 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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