Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6594J3QM43 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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