Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21244J3QK38 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21244J3QK38 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21244J3QK38 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21244J3QK38 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21244J3QK38 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21244J3QK38 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21244J3QK38 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21244J3QK38 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21244J3QK38 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21244J3QK38 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21244J3QK38 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21244J3QK38 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21244J3QK38 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21244J3QK38 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21244J3QK38 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21244J3QK38 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21244J3QK38 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21244J3QK38 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21244J3QK38 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21244J3QK38 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms