Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms