Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms