Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddx60E9PZQ1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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