Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms