Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms