Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4950D3YUM8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm4950D3YUM8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm4950D3YUM8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm4950D3YUM8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm4950D3YUM8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm4950D3YUM8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm4950D3YUM8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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