Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cfap58B2RW38 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cfap58B2RW38 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms