Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms