Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms