Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox1B1APN4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms