Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3173A6NAS3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3173A6NAS3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms