Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Palm3A2TJV2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms