Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Scn3aA2ASI5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scn3aA2ASI5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms