Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms