Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700023F06RikA2AB62 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms