Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1bA1Z198 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms