Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms