Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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