Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXZ4

Ighv1-62-2, Immunoglobulin heavy variable 1-62-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms