Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B694

Trav14-2, T cell receptor alpha variable 14-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav14-2A0A075B694 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms