Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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