Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
ChmQ9QXG2 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Txn-ps1-201ENSMUST00000186385 309 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Chil5-203ENSMUST00000200146 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms