Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Dcdc2a-202ENSMUST00000069614 6634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Ank2-201ENSMUST00000044443 5775 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm43684-201ENSMUST00000199279 6573 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms