Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ercc8Q8CFD5 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.1 ms