Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Prkaa2-201ENSMUST00000030243 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Csf2rb2-201ENSMUST00000096356 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gtf2a1-201ENSMUST00000021345 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
DmdP11531 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Olfr1276-203ENSMUST00000218065 5052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DmdP11531 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DmdP11531 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
DmdP11531 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms