Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TtrP07309 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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TtrP07309 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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TtrP07309 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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TtrP07309 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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TtrP07309 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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TtrP07309 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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TtrP07309 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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