Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Epg5-201ENSMUST00000044622 9672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Map1b-201ENSMUST00000064762 11808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Rffl-203ENSMUST00000074515 4973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.7 ms