Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 4833420G17Rik-203ENSMUST00000224312 3406 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm37841-201ENSMUST00000195367 376 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NcanP55066 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Nutm1-201ENSMUST00000043970 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Etl4-203ENSMUST00000114604 4786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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NcanP55066 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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NcanP55066 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Ptpn3-201ENSMUST00000075637 6369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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