Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm26520-201ENSMUST00000180719 1423 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Dennd2d-204ENSMUST00000183271 2050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Zkscan5-201ENSMUST00000031601 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 AC164437.4-204ENSMUST00000227169 4024 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Usp7-208ENSMUST00000161046 4003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Churc1-202ENSMUST00000110399 535 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Bbs9-211ENSMUST00000150395 3425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Cwc22-205ENSMUST00000111824 2603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Olfr686-203ENSMUST00000216143 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 AC153862.1-201ENSMUST00000215700 3349 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 2600014E21Rik-201ENSMUST00000186411 4805 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 C87436-202ENSMUST00000113698 2922 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Vipas39-201ENSMUST00000021426 2509 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Clcn3-205ENSMUST00000110302 3768 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Creb1-201ENSMUST00000049932 5009 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Wls-201ENSMUST00000068952 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
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Cxxc1Q9CWW7 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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Cxxc1Q9CWW7 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Pcdhga1-202ENSMUST00000194888 3247 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Tmem175-202ENSMUST00000078323 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm1988-201ENSMUST00000188190 2565 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Slc2a9-205ENSMUST00000129099 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm14186-201ENSMUST00000120804 137 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm13358-201ENSMUST00000121427 569 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Myl2-201ENSMUST00000014080 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Sp100-210ENSMUST00000147552 1597 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cxxc1Q9CWW7 Ly6a-205ENSMUST00000189068 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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