Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Osbpl9-218ENSMUST00000162787 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Hbp1-202ENSMUST00000172314 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Aoc3-202ENSMUST00000103105 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Kdm2b-205ENSMUST00000121739 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm8188-201ENSMUST00000219737 1690 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Cpne5-201ENSMUST00000024805 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Thsd1-202ENSMUST00000160585 3276 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Lrrcc1-202ENSMUST00000108370 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm43420-201ENSMUST00000198012 1857 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Polr3f-202ENSMUST00000110017 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Smim1-202ENSMUST00000126119 3996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Baiap3-201ENSMUST00000169109 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Chd8-212ENSMUST00000200169 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm12133-201ENSMUST00000121775 661 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm3275-201ENSMUST00000169145 487 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Igkv4-54-201ENSMUST00000177697 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm6967-201ENSMUST00000182599 1007 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm45846-201ENSMUST00000211170 446 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Figla-201ENSMUST00000032070 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm4883-201ENSMUST00000085702 528 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Phf8-206ENSMUST00000112670 3484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Scnn1a-203ENSMUST00000176110 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Arid3b-201ENSMUST00000004780 3785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 2310043P16Rik-201ENSMUST00000205403 3881 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Lias-201ENSMUST00000031101 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Dgkd-201ENSMUST00000027517 5695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Magea2-201ENSMUST00000069477 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Myo7b-201ENSMUST00000134663 6621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Mfsd2b-204ENSMUST00000137337 2641 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Piwil4-201ENSMUST00000076946 2637 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gabrb3-206ENSMUST00000196198 4348 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 A330049N07Rik-203ENSMUST00000220010 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm17473-202ENSMUST00000228544 2071 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Flad1-201ENSMUST00000050398 3007 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Zeb2-215ENSMUST00000200844 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 P2rx7-201ENSMUST00000031425 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Rcbtb2-201ENSMUST00000022702 2971 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Cdc25b-201ENSMUST00000028804 3089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Cpsf1-201ENSMUST00000071898 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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