Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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