Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Ccl20O89093 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Ccl20O89093 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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