Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Paqr8-201ENSMUST00000068880 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Rnmt-201ENSMUST00000009679 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtprkP35822 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms