Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3550W4VSN7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms