Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms