Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mtmr1Q9Z2C4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mtmr1Q9Z2C4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mtmr1Q9Z2C4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mtmr1Q9Z2C4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mtmr1Q9Z2C4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mtmr1Q9Z2C4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Mtmr1Q9Z2C4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mtmr1Q9Z2C4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mtmr1Q9Z2C4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mtmr1Q9Z2C4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mtmr1Q9Z2C4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mtmr1Q9Z2C4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mtmr1Q9Z2C4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms