Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms