Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms