Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sfrp4Q9Z1N6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms