Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ap4s1Q9WVL1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ap4s1Q9WVL1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ap4s1Q9WVL1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ap4s1Q9WVL1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ap4s1Q9WVL1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ap4s1Q9WVL1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms