Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Sorbs3Q9R1Z8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sorbs3Q9R1Z8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms