Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trex2Q9R1A9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms