Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syt6Q9R0N8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms