Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms