Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a4Q9QZR9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col4a4Q9QZR9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms