Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clcf1Q9QZM3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms