Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cml5Q9QXS8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml5Q9QXS8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms